mtDNA è stato sviluppato
in collaborazione con il
Centro di Antropologia
molecolare per lo studio del DNA antico
caratteristiche
mtDNA
nasce dall’esigenza di specializzare e personalizzare l'approccio bioinformatico nello studio del DNA
mitocondriale, con un occhio di riguardo al segmento d-loop.
Come sempre esistono ottimi prodotti software che risolvono moltissime problematiche, ma non possono, proprio
per la loro non specificità, supportare in un unico passaggio tutto l'iter elaborativo. mtDNA ha lo scopo di velocizzare alcuni passaggi sinora delegati a più programmi in sequenza se
non addirittura ad un approccio manuale.
Le funzionalità di mtDNA sono attualmente volte a normalizzare i dati in possesso dei ricercatori.
Tali dati provengono da:
1 - file in formato ARLEQUIN
2 - file in formato FASTA
3 - tabelle personali e non
Questi dati possono essere normalizzati in file con formato FASTA o Arlequin compatibile.
Le tabelle, create da risultati di laboratorio interni od esterni, costruite secondo il formato descritto di
seguito possono essere sottoposte ad un controllo di mutazioni su una lista di posizioni scelta.
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