Enrico Fabrini - mtDNA

 

Sei approdato nel bel mezzo di una tempesta di idee.
Non la solita tempesta,
una più grande.

aggiornamenti

10 ottobre 2005

Nasce l'esigenza di un sito italiano specializzato nel software di supporto alla ricerca sul DNA mitocondriale.

8 gennaio 2009

Versione online per la ricerca degli aplogruppi.(clic per richiamarla)

cosa trovi sul sito

ultima versione software

 

per trasferire il software
fai clic sulla figura

mtDNA è stato sviluppato
in collaborazione con il
Centro di Antropologia molecolare
per lo studio del DNA antico

caratteristiche

mtDNA nasce dall’esigenza di specializzare e personalizzare l'approccio bioinformatico nello studio del DNA mitocondriale, con un occhio di riguardo al segmento d-loop.
Come sempre esistono ottimi prodotti software che risolvono moltissime problematiche, ma non possono, proprio per la loro non specificità, supportare in un unico passaggio tutto l'iter elaborativo.
mtDNA ha lo scopo di velocizzare alcuni passaggi sinora delegati a più programmi in sequenza se non addirittura ad un approccio manuale.
Le funzionalità di mtDNA sono attualmente volte a normalizzare i dati in possesso dei ricercatori.
Tali dati provengono da:

Questi dati possono essere normalizzati in file con formato FASTA o Arlequin compatibile.
Le tabelle, create da risultati di laboratorio interni od esterni, costruite secondo il formato descritto di seguito possono essere sottoposte ad un controllo di mutazioni su una lista di posizioni scelta.

sequenza riferimento

Anderson et al. (1981) (CRS)
Anderson et al. (1981) (d-loop)
Anderson et al. (1981) (HV1)
Anderson et al. (1981) (HV2)

sequenze parziali

Anderson et al. (1981) (d-loop)
Anderson et al. (1981) (HV1)
Anderson et al. (1981) (HV2)

database aplotipi

Andalusia Berber Dutch Iraqi-Israeli Italian Morocco Navajo SouthAfrican

sequenze d-loop

Homo Sapiens Gorilla Pan troglodytes

contatti

fabrini (chiocciolina) tiscali (punto) it

avvertenze

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